我想问一下，美国硕士申请提交的GGPA是按本科学校教务处计算的GPA还是自己计算的GPA（加权平均）？

这要看你申请的学校怎么要求。有的是直接让你填本科学校计算的，并写明计算方法，有的需要你自己来算。但成绩单上显示的一般都是学校计算的，跟校网系统上一致的。